มูลนิธิสืบนาคะเสถียร ก่อตั้งขึ้น 18 วัน หลังจากการจากไปของคุณสืบ โดยเพื่อนพ้องน้องพี่ในแวดวงนักอนุรักษ์ เพื่อสืบสานเจตนารมณ์การอนุรักษ์อย่างเป็นรูปธรรม ต่อจากสืบ นาคะเสถียร
ทศวรรษแรกของการขับเคลื่อนองค์กร ในรูปแบบขององค์กรสาธารณะด้านการอนุรักษ์ เป็นภารกิจที่ท้าท้ายภายใต้การจับตามองของสังคมไทย ผ่านการวางรากฐานอนุรักษ์อย่างเป็นรูปธรรม
โดยภารกิจหลักอันดับแรกคือ ส่งเสริมและสนับสนุนสวัสดิการและการดำเนินงานของพนักงานเจ้าหน้าที่ และลูกจ้างของเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าห้วยขาแข้ง และเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าทุ่งใหญ่นเรศวร และส่งเสริมและสนับสนุนสวัสดิการและการดำเนินงานของพนักงานเจ้าหน้าที่ และลูกจ้างของเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าและเขตห้ามล่าสัตว์ป่าอื่นๆ
และเริ่มต้นทำงานวิชาการเฝ้าระวังโครงการที่จะส่งผลกระทบต่อผืนป่าและสัตว์ป่า การคัดค้านถนนผ่าป่า 48 สาย ภายใต้กระแสการพัฒนาประเทศ
ผ่านการบริหารองค์กรแบบ “Small is Beautiful”
เรื่องราวทศวรรษแรกในการทำงานของมูลนิธิสืบฯ กับบทบาทองค์กรอนุรักษ์ของประเทศไทย ได้ถูกถ่ายทอดผ่านการสนทนา โดยภาณุเดช เกิดมะลิ เลขาธิการมูลนิธิสืบนาคะเสถียร และอรยุพา สังขมาน รองเลขาธิการมูลนิธิสืบมูลนิธิสืบนาคะเสถียร ใน SEUB TALK SPECIAL ตอน 3 ทศวรรษมูลนิธิสืบนาคะเสถียร ตอนที่ 1
วัตถุประสงค์เมื่อก่อตั้งมูลนิธิฯ พ.ศ. 2533 ประกอบ
1. ส่งเสริมและสนับสนุนสวัสดิการและการดำเนินงานของพนักงานเจ้าหน้าที่ และลูกจ้างของเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าห้วยขาแข้ง และเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าทุ่งใหญ่นเรศวร
2. ส่งเสริมและสนับสนุนสวัสดิการและการดำเนินงานของพนักงานเจ้าหน้าที่ และลูกจ้างของเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าและเขตห้ามล่าสัตว์ป่าอื่นๆ
3. ส่งเสริมและสนับสนุนให้ประชาชนที่อยู่ในบริเวณใกล้เคียงพื้นที่เขตอนุรักษ์ ตระหนักถึงความสำคัญของการอนุรักษ์ป่าไม้และสัตว์ป่า และมีส่วนร่วมในการดูแลรักษาทรัพยากรธรรมชาติเหล่านั้น
4. ส่งเสริมและสนับสนุนการอนุรักษ์สัตว์ป่า ทรัพยากรธรรมชาติ และคุณภาพสิ่งแวดล้อมของประเทศ
5. ส่งเสริมและสนับสนุนการก่อให้เกิดความรู้ ความคิดเห็นและการเผยแพร่ความรู้ทางวิชาการเกี่ยวกับการอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติและการรักษาคุณภาพสิ่งแวดล้อม
6. เพื่อดำเนินการหรือร่วมมือกับองค์กรการกุศลอื่นๆ เพื่อสาธารณประโยชน์
7. ไม่ดำเนินการเกี่ยวข้องกับการเมืองแต่ประการใด
ขอขอบคุณ ธนาคารไทยพานิชย์ จำกัด (มหาชน) บริษัท เท็กซ์ไทล์ แกลลอรี่ จำกัด บริษัท เจริญโภคภัณฑ์อาหาร จำกัด (มหาชน) และบริษัท ซีพี ออลล์ จำกัด (มหาชน)
